Doctorant-e : S’inspirer de modèles naturels résistants à l’atrophie musculaire pour trouver de nouvelles cibles thérapeutiques
A propos de nous
L'Université Clermont Auvergne (UCA) se distingue par sa communauté dynamique de plus de 36 000 étudiants, 2 000 enseignants et chercheurs, ainsi que 1 500 personnels techniques et administratifs. L'UCA est une université territoriale qui jouit d'une réputation tant nationale qu'internationale entretenant de forts liens avec son environnement socio-économique et culturel, sa gamme étendue de disciplines de recherche et d'enseignement. En 2022, l'UCA a intégré le « top 17 » des universités françaises titulaires d’un label d’excellence, avec pour thème identitaire fédérateur : concevoir des modèles de vie et de production durables.
Mission proposée
Référence : PP17
Titre : S’inspirer de modèles naturels résistants à l'atrophie musculaire pour trouver de nouvelles cibles thérapeutiques
Début de contrat : 01/01/27
Durée : 36 mois
Date limite de candidature : 6/05/26
Job description
Les maladies chroniques se caractérisent par un état catabolique entraînant une fonte musculaire, qui se traduit par une faiblesse, une morbidité accrue et une espérance de vie réduite. À l'heure actuelle, il n'existe aucun traitement thérapeutique contre l'atrophie musculaire. Le système ubiquitine-protéasome (UPS) et l'autophagie sélective jouent un rôle majeur dans ce processus, dans ces conditions cataboliques. Afin d'identifier de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles pour lutter contre l'atrophie musculaire, nous avons comparé deux modèles cataboliques d'immobilisation prolongée : l'un sensible à l'atrophie musculaire et l'autre naturellement résistant. Cette comparaison a mis en évidence plusieurs gènes régulés de manière opposée, qui pourraient donc être à l'origine de la différence phénotypique observée (atrophie musculaire versus résistance à l'atrophie). Parmi ces gènes figurent certains impliqués dans le processus d'ubiquitination. La comparaison de ces résultats avec ceux d'autres analyses globales de l'atrophie musculaire met en évidence six gènes candidats codant pour des ligases E3.
Le/la doctorant/e recruté/e (DF01) réduira l'expression de ces ligases E3 dans des myotubes de rongeurs en culture, soumis ou non à des conditions cataboliques, afin de confirmer ou d'infirmer leur implication dans le processus d'atrophie. L'étudiant mesurera : le diamètre des myotubes ; la quantité de protéines contractiles [par immunoblotting] ; les niveaux d'expression d'atrogènes tels que MuRF1, MAFbx, Atg8 [par ddRT-PCR].
La localisation subcellulaire du candidat E3 le plus prometteur sera évaluée par immunofluorescence sur des fibres musculaires de souris extraites.
Pour ce candidat E3, les mécanismes sous-jacents au phénotype observé seront étudiés en identifiant les partenaires d'interaction directs par criblage « yeast two-hybrid » sur une banque d'ADNc musculaire humain (sous-traitance). L'étudiant confirmera et caractérisera les interactions avec le partenaire identifié à l'aide d'approches biophysiques et/ou intracellulaires complémentaires [résonance plasmonique de surface, Monolith ou SplitGFP]. Il déterminera ensuite si ces partenaires sont des régulateurs ou des cibles de la ligase E3 candidate à l'aide d'un test de dégradation intracellulaire.
Ce projet de thèse sera mené en collaboration avec Vincent Gache, de l'Institut NeuroMyogène, situé au 8 avenue Rockefeller, à Lyon
Directrice (70%): Cécile POLGE
Co-directrice (30%): Lydie COMBARET
Lieu de travail : UNH, Centre de Recherche INRAE, Route de Theix, 63122 Saint Genès Champanelle
Notre profil idéal
Diplôme exigé : Master ou diplôme équivalent en biologie
Compétences techniques :
Culture cellulaire (asepsie, maintenance de lignées, transfection cellulaire, tests fonctionnels).
Biochimie des protéines (extraction, quantification, western blot, purification)
Compétences analytiques et théoriques :
Conception d'expériences (par exemple, inclusion de contrôles appropriés (contrôles négatifs et positifs, contrôles de chargement, etc.))
Bio-informatique de base (outils d'alignement de séquences, utilisation de bases de données (par exemple, Uniport, PDB))
Analyse statistique (GraphPad Prism ou R)
Compétences relationnelles :
Capacité à mener plusieurs tâches de front avec rigueur,
Résilience et capacité à résoudre les problèmes
Curiosité scientifique
Autonomie et gestion du temps
Mots clés : Atrophie musculaire ; protéolyse ; ubiquitine ligase ; myotubes de rongeurs en culture ; localisation subcellulaire ; interactomique
Critères obligatoires
Le doctorant :
ne doit pas avoir résidé ni exercé son activité principale (travail, études) dans le pays où il est recruté, à savoir la France, pendant plus de 12 mois au cours des trois années précédant la date limite de dépôt des candidatures, sauf si cette période s'inscrit dans le cadre d'un service national obligatoire ou d'une procédure d'obtention du statut de réfugié au titre de la Convention de Genève.
doit être doctorant (ne pas être déjà titulaire d'un doctorat à la date limite de dépôt des candidatures).
Les compétences orales et écrites doivent répondre aux normes de l'anglais académique utilisé dans la recherche internationale.
Détails du poste :
L'allocation mensuelle de subsistance, charges sociales patronales et salariales comprises, s'élève à 3 500 €. Ce montant correspond à un salaire mensuel brut estimé à 2393€.
En plus du salaire mensuel, le doctorant percevra une indemnité de mobilité, comprenant les charges sociales patronales et salariales, d'un montant de 132 € par mois pendant 36 mois, ce qui correspond à une indemnité mensuelle brute de 94€ environ.
Protection sociale :
Le doctorant bénéficiera d'une couverture sociale complète, comprenant l'assurance maladie, l'assurance chômage et les cotisations de retraite. Il aura également accès aux services de médecine du travail, conformément au droit du travail français.
Assurance complémentaire :
En application du décret 2022-633 du 22 avril 2022 modifié, les personnels du Ministère de l’Éducation Nationale, de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche sont tenus d'adhérer au contrat collectif de protection sociale complémentaire « santé » souscrit par leur employeur. Vous devrez vous affilier dès votre date d'arrivée à l'UCA. Toutefois, dans certains cas, vous aurez la possibilité de demander une dispense. Informations disponibles ici.
Congés payés :
Le doctorant a droit à un maximum de 44 jours de congés payés par an, conformément au droit du travail national, et bénéficiera des mêmes droits sociaux que les autres employés du secteur public, y compris l'adhésion à un syndicat étudiant.
Transports :
Le doctorant bénéficie de tarifs fortement réduits sur les transports publics, disponibles dans toutes les villes partenaires. De plus, l'établissement d'accueil peut prendre en charge 75 % des frais de transport mensuels.
Les candidatures sont à soumettre exlcusivement via ce lien : https://www.muskle.eu/recruitment/
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